反滲透設備具有高效的除鹽工藝，因此只需要將二氧化碳轉化為碳酸氫鹽就可以利用反滲透設備去除二氧化碳，由于H(+)+HCO3(-)=H2CO3=CO2+H2O，而這個化學反應時可逆的，當氫氧根增加時，該反應就會向左進行，而當水中的OH值大于8.2時，水中的二氧化碳將全部轉化為碳酸氫根，這樣碳酸氫根就會通過反滲透設備全部去除，間接實驗了去除二氧化碳的目的。
但是，在加入堿的同時，反滲透設備的反滲透膜
發生反應的方程式為Ca(+)+2OH(-)+CO2=CaCO3+H2O;Mg2(+)+2OH(-)=MgCO3+H2O。
因此必須要在RO之前進行阻垢劑的添加，以避免在反滲透膜上結垢。
原水水質的不同，也會對反滲透設備的清洗周期產生影響，如果水中所含的有機物含量較高，并且會受到季節變化的影響，在使用一段時間后，進口操作壓就會增加，而段間的壓差不變，必須要經過清洗過后才可以恢復正常狀態，但是在使用過一段時間后，這種狀況就會重復出現。
隨著科技的發展，目前反滲透設備的阻垢劑品種繁多，阻止結垢的效果越來越好，阻垢劑的使用，可以使反滲透設備的清洗時間間隔延長。
